폐고혈압의 증상은 많은 다른 질환의 증상과 유사하기 때문에 폐고혈압의 진단은 일반적으로 그러한 증상을 일으키는 다른 병들을 하나씩 주의 깊게 제외하는 과정을 통해 내려지게 됩니다.
그러나 아직까지도 많은 의사들이 감별해야 할 질병목록에 폐고혈압을 넣어두고 있지 않기 때문에 혹은 더 많은 경우 폐고혈압에 대해 알지 못하기 때문에 자신은 평생 폐고혈압 환자를 만나지 못했다고 생각합니다.
따라서 폐고혈압 환자는 잦은 오진을 경험하게 됩니다.
천식이라든지 과다한 스트레스로 인한 증상이라는 설명이 흔히 듣는 잘못된 진단의 예입니다.

폐고혈압 진단이 어려운 또 하나의 이유는 같은 폐고혈압 환자라 할지라도 꼭 같은 증상을 보이지는 않기 때문입니다.

따라서, 다음 기술하는 증상에 관해 의사가 다른 명백한 원인을 설명해주지 못하는 경우에는 폐고혈압을 의심하고 심장 초음파 검사를 받아볼 것을 권합니다. 물론 폐고혈압 이외의 많은 질환에서도 이런 증상이 나타날 수 있습니다.
 

공기가 부족한 느낌, 전문용어로는 호흡곤란이라 합니다.
이것은 폐고혈압의 가장 흔한 증상입니다.
폐고혈압 환자의 상당수는 이러한 증상을 주로 몸을 움직일 때 느끼지만 심한 경우 식사 중이나 식사 후에도 느낍니다.

특히 몸을 움직일 때 발생합니다.
몸을 움직일 때 무언가가 가슴을 세게 치는 것과 같은 느낌을 받습니다.
폐고혈압 환자의 약 1/3 이 이러한 증상을 가지고 있습니다.

일어날 때, 계단을 올라갈 때나 구부린 자세에서 일어나려 할 때 나타납니다.

뇌가 충분한 산소를 공급받지 못할 때 발생합니다.
이것은 뇌로 충분한 혈액공급이 되지 않기 때문입니다.
환자, 특히 어린이들은 과격한 활동으로 실신하는 경우가 있습니다.

흔히 의사들은 부종이라 표현하며 이 또한 매우 흔한 증상입니다.
부종이 생긴 다리를 손가락으로 누르면 누른 자국이 잠시 동안 남아 있게 됩니다.

만성피로와 많은 약제 혹은 폐고혈압과 맞서야 한다는 스트레스가 환자들을 우울증에 빠지게 합니다.

많은 환자들이 마른 기침을 호소합니다.
가래를 뱉어 내었을 때 피가 묻어 나오는 경우도 있는데 이를 객혈이라 합니다.
왜 기침이 나오는지를 명확히 설명하기는 어렵지만 아마도 커진 심장이 근처를 지나가는 신경을 누르거나 일부 폐고혈압 약제로 인해 또는 폐에 물이 고였기 때문이라 생각합니다.

이것은 손ᆞ발가락이 추위에 쉽게 차가워지고 퍼렇게 변색되는 것을 말하며 이러한 현상은 환자의 폐고혈압이 결합조직 질환에 의해 이차적으로 발생한 경우 특히 많이 나타납니다. (결합조직: 신체에서 피부, 근육, 신경 등을 서로 연결하고 영양을 공급하는 역할을 하는 조직)